Di Thunderbird 2.0 balza subito all'occhio l'aggiornamento del tema grafico, ora più sobrio e accattivante, e dell'interfaccia, che pur non rivoluzionando quella precedente introduce alcune novità. Tra queste due nuovi bottoni che, similmente ai tasti avanti e indietro dei browser, permettono di navigare nella cronologia dei messaggi, e la possibilità di personalizzare il panello laterale delle mailbox, così da visualizzare soltanto le cartelle preferite, più recenti o non lette: è possibile passare da un visuale all'altra con un click.

Sempre in tema di interfaccia utente vale la pena citare la funzione folder summary popups, che si attiva quando ci si sofferma con la freccia del mouse su di una cartella contenente dei messaggi ancora non letti: in questo caso appare un piccolo popup che sintetizza i dati salienti delle email ancora non lette, quali mittente, oggetto e incipit.

Il layout rimane invece quello classico, con una finestra verticale a sinistra per le mailbox e due finestre centrali per messaggi e anteprima: una disposizione volutamente molto simile a quella di Outlook Express, e in ogni caso ampiamente personalizzabile.

Con la nuova release di Thunderbird, gli sviluppatori si sono focalizzati soprattutto nel migliorare la gestione dei messaggi, che ora possono essere classificati, etichettati e ricercati in modi nuovi e più avanzati. Ad esempio, gli utenti possono ora assegnare ad ogni email uno o più tag, ossia delle etichette con le quali catalogare e ordinare la posta, eventualmente organizzandola in cartelle virtuali. Si può scegliere se utilizzare le etichette predefinite, come Importante, Personale, Da fare, Più tardi e Lavoro, oppure creare tag personalizzati.

"In Thunderbird 2 abbiamo applicato alla posta elettronica i metodi più diffusi per organizzare informazioni online e contenuti, incluso il sistema di tag", ha spiegato Scott MacGregor, ingegnere di Mozilla Foundation responsabile di Thunderbird. "I tag si sono dimostrati utili per organizzare le informazioni sui blog e sui siti di condivisione di notizie e foto, e funzionano altrettanto bene con la gestione dei messaggi".

Nel nuovo Thunderbird gli utenti hanno inoltre a disposizione un box di ricerca di tipo find as you type, ovvero in grado di iniziare le ricerche non appena si digitano i primi caratteri della parola chiave, in grado di cercare frasi e parole anche all'interno del testo di tutti i messaggi contenuti in una cartella. Come già succedeva con la versione 1.5, è inoltre possibile salvare il risultato delle ricerche in una cartella virtuale.